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Intelligent Bioinformatics Research Group

ABOUT US

Introduction

The Intelligent Bioinformatics Research Group was established in September 2020 by Professor Jianbo Pan.It is part of Center for Novel target and therapeutic intervention, Chongqing Medical University Life Science Research Institute. Our group focuse on data processing in drug-related fields, on the one hand is bioinformatics assists pharmacogenomics research, on the other hand we focuse on computer technologies aid drug discovery such as big data and artificial intelligence. Currently, we have high-performance computing clusters, GPU servers, high-performance computers, and intelligent bioinformatics platforms, which provide good support for Bioinformatics research and drug research related work.

Publication List

1. Integrated Proteogenomic Characterization of Clear Cell Renal Cell Carcinoma

2. Glycoproteomics-based Signatures for Tumor Subtyping and Clinical Outcome Prediction of High-Grade Serous Ovarian Cancer

3. AAgMarker 1.0: a resource of serological autoantigen biomarkers for clinical diagnosis and prognosis of various human diseases

4. Identification of Serological Biomarkers for Early Diagnosis of Lung Cancer Using a Protein Array-Based Approach

5. A quantitative proteomics approach identifies new regulators of an ERG-driven transcriptional network

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Process

TEAM

Tutors

Jianbo Pan

重庆医科大学生命科学研究院,特聘教授,博士生导师

教育经历:

2005-2009年:厦门大学,学士
2009-2014年:厦门大学,化学生物学博士,方向生物信息学
2014年-2020年:美国约翰霍普金斯大学医学院,生物信息学博士后
2020年加入重庆医科大学生命科学研究院,任特聘教授

研究方向:

1. 生物信息学辅助药物基因组学研究;
2. 癌症组学数据分析以及多组学整合研究;
3. 生物信息学数据库和分析工具的开发;
4. 基于蛋白芯片的肿瘤自身抗体标志物的发现与验证。

E-mail:panjianbo@cqmu.edu.cn

Shiyong Ma

重庆医科大学生命科学研究院,副教授,硕士生导师

教育经历:

2005-2009:西安电子科技大学,通信工程学院,学士
2009-2012:西安电子科技大学,通信工程学院,图像处理与模式识别专业硕士
2012-2016:澳大利亚新南威尔士大学,Lowy肿瘤研究中心,生物信息学博士
2017-2020:美国约翰斯霍普金斯大学医学院,肿瘤生物标识物与转化研究中心,博士后研究员
2021年1月加入重庆医科大学生命科学研究院,任副教授

研究方向:

1. 使用并设计基于统计学习和知识迁移的计算方法,对大量肿瘤样本的的蛋白质组与基因组数据进行分析和计算,旨在发现不同疾病通路的蛋白质和基因表达模式;
2. 推演新的数学和计算方法来识别复杂的高维度的组学数据的表达模式,进而构建对于疾病个体化诊断和管理的预测性模型。

E-mail:felixshiyong@gmail.com

Graduate students

李强
主要研究:

人工智能辅助药物小分子发现

马钦锋
主要研究:

药物基因组学

翟朝宇
教育经历:

本科:哈尔滨医科大学,医学信息工程
硕士:重庆医科大学,生物信息学

张雪鲁
教育经历:

本科:山东第一医科大学,生物信息学
硕士:重庆医科大学,生物信息学

周露
教育经历:

本科:山西农业大学,生物信息学
硕士:重庆医科大学,生物信息学

高洁雅
教育经历:

本科:,
硕士:,

况霓
教育经历:

本科:,
硕士:,

林哲威
教育经历:

本科:,
硕士:,

DAILY

2020 Annual Meeting
tutti-dream-seeker

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E-mail :panjianbo@cqmu.edu.cn

Postcode :400016

Address : 重庆市渝中区医学院路1号

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